Los muestreadores de agua son botellas especiales utilizadas para la toma de las muestras que van a ser analizadas.

En función de los requisitos del muestreo se pueden seleccionar botellas tipo Niskin, Van Dorn y Ruttner.

Las redes de plancton se utilizan para la recogida de muestras de plancton. Para la determinación de la cantidad de agua que pasa a través de la red se utilizan los medidores de flujo.